时鹏
发布时间: 2014-05-26 访问次数: 1466

时鹏(1980-),男,博士,副教授,硕士生导师

  

联系方式

pshi@fjnu.edu.cn

  

简介

2008年毕业于中国科学院自动化研究所,获计算机应用专业博士学位;2008-2011年在美国康奈尔大学附属休斯顿卫理公会医院研究所生物技术与信息学研究中心从事医学图像处理及生物信息学研究;2011-2013年在美国莱斯大学生物工程系进行系统生物学及生物图像分析研究;2013年至今在福建师范大学任教,并于2017年到英国阿尔斯特大学计算机系访学。目前主持国家自然科学基金青年项目1项,省部级重点项目1项,省部级面上项目2项、青年项目1项。主要研究乳腺癌、淋巴瘤、阿尔兹海默症等疾病机理的识别与分类,探讨钼靶影像、病理显微图像、肺部CT图像、神经细胞显微图像等多类医学图像的处理与分析方法,实现并改进了在复杂医学图像中进行机器学习的建模与算法,并成功应用在诸如乳腺钼靶影像分割、淋巴癌病理图像分级检测以及神经细胞树突棘三维重建分类等方面。近年来在包括Magnetic Resonance ImagingJournal of Biomedical OpticsBiomedical Optics ExpressScientific Reports等医学和图像处理期刊上发表SCI学术论文,并在ICMLISBIITME等机器学习、医学影像处理国际学术会议发布相关成果。

  

研究方向

模式识别,医学图像处理,人工智能,机器学习

  

学术任职

电气和电子工程师协会会员,IEEE Member

国际计算机学会会员,ACM Member

中国计算机学会会员,CCF Member

  

教学课程

研究生课程:算法原理及应用

本科生课程:数据结构、数据库原理及应用、人工智能

  

科研项目

1. “基于半监督学习的神经细胞树突棘三维形态分析”,国家自然科学基金青年项目,2016.01-2018.12,在研,负责人

2. “磁共振弥散加权成像在淋巴瘤诊断、侵袭性和预后评估中的临床应用及其病理相关性研究”,福建省自然科学基金引导性项目,2016.04-2019.04,在研,合作单位负责人

3. “基于线性结构追踪与层次树模型的鸡胚尿囊膜血管新生自动测量算法研究”,教育部留学回国人员基金项目,2015.06-2018.05,在研,负责人

4. “神经元树突棘的半监督学习建模与分类”,福建省自然科学基金青年创新项目,2015.04-2018.04,在研,负责人

5. “基于Hessian矩阵与几何信息的鸡胚血管自动测量算法研究”,福建省省教育厅A类项目,2014.09-2017.08,已结题,负责人

6. “高维序列数据的核学习方法及应用研究”,国家自然科学基金面上项目,2017.01-2020.12,在研,参与

7. “基于稀疏表示分类的高内涵筛选显微图像神经突骨架提取研究”,国家自然科学基金青年项目,2013.01-2016.12,在研,参与

  

近期代表性论文

  • P. Shi, J. Zhong, A. Rampun, H. Wang, A Hierarchical Pipeline for Breast Boundary Segmentation and Calcification Detection in Mammograms, Computers in Biology and Medicine, 2018, To appear.

  • J. Zhong, P. Shi, Y. Chen, R. Huang, Y. Xiao, X. Zheng, D. Zheng, L. Peng, Diffusion kurtosis imaging of human nasopharyngeal carcinoma xenograft model: Initial experience with pathological correlation, Magnetic Resonance Imaging, 2018, 47: 111-117.

  • P. Shi, J. Chen, J. Lin, and L. Zhang, High-throughput fat quantifications of hematoxylin-eosin stained liver histopathological images based on pixel-wise clustering, SCIENCE CHINA Information Sciences, 60(9), 092108 (2017).

  • P. Shi, J. Zhong, J. Hong, R. Huang, K. Wang, and Y. Chen, Automated Ki-67 Quantification of Immunohistochemical Staining Image of Human Nasopharyngeal Carcinoma Xenografts, Scientific Reports, Nature Publishing Group, Vol.6, pp. 36127, 2016.

  • P. Shi, J. Hong, Y. Huang, Z. Zhang, M. Zhang, and L. Zhang, An automated computational framework of blood vessel quantification in chick chorioallantoic membrane angiogenesis, Journal of Biomedical Optics, Vol.19, No.10, p. e106005, 2014.

  • P. Shi, Y. Huang, and J. Hong, Automated three-dimensional reconstruction and morphological analysis of dendritic spines based on semi-supervised learning, Biomedical Optics Express, Vol.5, No.5, pp. 1541-53, 2014.

      

    授权与申请专利

    1.“基于像素邻域特征聚类的淋巴结HE染色病理图像分割方法”,发明专利,受理号201710200127.1

    2.“乳腺钼靶图像乳房区域分割与钙化点检测方法”,发明专利,受理号201711312146.X

    3.“基于轻量级神经网络的乳腺钼靶深度学习分类方法”,发明专利,受理号201711343994.7

    4.“一种荧光原位杂交(FISH)图像并行处理与分析方法”,发明专利,受理号201510288553.6

    5.“基于奇异点拓扑结构的快速指纹识别方法”,发明专利ZL200610112936.9,授权公告日2010.4.7.

    6.“基于局部结构的双胞胎相似指纹识别系统及方法”,发明专利ZL200610113409.X,授权公告日2009.12.30.

    7.“一种指纹识别无线射频卡的身份认证系统及方法”,发明专利ZL200510086958.8,授权公告日2009.2.4.

    8.“一种双胞胎相似指纹识别装置”,实用新型ZL200620133909.5,授权公告日2007.11.7.

        9.“一种指纹识别无线射频卡的身份认证装置”,实用新型ZL200520114673.6,授权公告日2007.5.2.